Сред използваните от персонала наказания са бой с метална пръчка, щипане, лишаване от храна в определеното време. Върху децата е осъществяван и психически тормоз – изолация или заключване навън вечер, заплахи и лишаване от любими за децата занимания. Случаите не са отразени документално от ръководството на ЦНСТ, нито е съобщило за тях на органите по закрила.

Според проверяващите налице е неглижиране на децата и оставяне без надзор, видеонаблюдението се е осъществявало формално и е неефективно, нямало е и определен служител, който да следи камерите. Поради тази причина персоналът дори не е разбрал за инцидент, при който едно от по-големите деца е провесило друго през парапета на стълбището, а на помощ са му се притекли няколко момчета. 

Констатирано е още, че децата е нямало с кого да споделят преживяното през деня в детската градина или училище. Свободното време, посещението им на училище и на детска градина се планирало и се извършвало в група, а не индивидуално, каквито са условията за създаване на среда близка до семейната.